Το Κ.Π.Ε. Σουφλίου, για την καλύτερη υποστήριξη των προγραμμάτων και των δραστηριοτήτων του, συνεργάζεται με τα παρακάτω επιστημονικά Ιδρύματα και τοπικούς φορείς:

• Τμήμα Δασολογίας και Διαχείρισης Περιβάλλοντος και Φυσικών Πόρων του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης.
• Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο.
• Πανεπιστήμιο Αιγαίου.
• Τον Δήμο Σουφλίου και τις Δημοτικές Επιχειρήσεις του.
• Εθνικό Ίδρυμα Αγροτικής Ανάπτυξης ( ΕΘ.Ι.ΑΓ.Ε. ) Κομοτηνής.
• Κέντρα Περιβαλλοντικής Εκπαίδευσης και Υπευθύνους Περιβαλλοντικής Εκπ/σης απ' όλη την Ελλάδα.
• Το Μουσείο Μετάξης Σουφλίου.
• Οικοτουριστικό Κέντρο Δαδιάς.
• Τοπικές ενώσεις, συλλόγους, οργανώσεις της περιοχής, στρατό, σχολεία, τοπική κοινωνία